Земля в верховьях рек Амударья и Сырдарья и их притоков всегда отличалась от остальной части Центральной Азии. Люди, живущие здесь, вели скорее оседлый образ жизни, чем кочевой, причем способы обработки земли и социальные структуры почти не менялись с 6 века до н.э. вплоть до 19 столетия. Этот регион был частью нескольких древнейших персидских государств. В 4 веке до н.э., Александр Великий проходил со своими войсками через этот регион и женился на дочери местного вождя, жившего под Самаркандом. При правлении Кушана в стране был введен Буддизм, а открытие Великого Шелкового Пути привело к развитию мирных связей с другими странами. Стали расти города, и регион стал богатеть. В 6 веке н.э. из степей появились западные турки, которые принесли с собой Ислам и письменность. Когда турки отошли в более зеленые места, Персия снова установила свою власть, до тех пор, пока Чингизхан и его орды не вторглись на территорию страны.
С появлением правителя Тимура (Тамерлана) в 14 веке, страна снова стала преуспевающей, а Самарканд стал процветающей исламской столицей, благодаря покровительству искусствам, оказываемому правителем. Примерно в это время некоторые племена Центральной Монголии стали называться узбеками. В 14 веке они стали двигаться на юг и в конце концов покорили империю Тимура. К 1510 году они контролировали всю территорию между реками Амударья и Сырдарья, и с этого времени данная территория всегда была узбекской. В начале 18 века, Хивинский хан обратился к Петру I с просьбой помочь защитить свои земли от набегов туркмен и казахов, тем самым у России впервые возник интерес к Центральной Азии. Хотя к тому времени, когда Россия собрала войска, чтобы отправиться в Хиву, хан уже не нуждался в их помощи, и почти вся армия была перебита. Если не принимать во внимание несколько небольших походов, следующая русская экспедиция в Центральную Азию была организована в 1839 году царем Николаем I, который стремился предотвратить усиление британского влияния в регионе, но эта задача не была выполнена. Спустя 25 лет была предпринята ещё одна попытка, и к 1875 году весь регион стал принадлежать России. После Революции 1917 года, большевики объявили о создании Автономной Советской Социалистической Республики Туркестан, несмотря на то, что большинство жителей Центральной Азии считали себя не жителями отдельной страны, а этническими турками или персами.
В октябре 1924 года была провозглашена республика Узбекистан. А в 1991 года, была провозглашена независимость Узбекистана.